灰指甲的治疗方法虽多，但因甲板较厚，外用药物不易透入，难以治。内服抗真菌药需长期、较大量的服用且对肝脏有一定的毒性，限制了其作用。目前有几种新型抗真菌药物，可以较短期地应用而达到治疗效果，为灰指甲治疗开辟了新途径。

1.特比萘芬：每日250mg，口服，3-4周；或250mg，隔日口服，6-8周，停药后病甲继续好转，直至新甲有效长出，适用于灰指甲患者，对于较重灰指甲，每日服药的疗程可延长至2个月。

2.伊曲康唑：每月第1周服药，治疗灰指甲服2个周期。

3.局部用药：先去除病甲，可选用40%尿素霜封包，用胶布保护正常皮肤，一周后病甲软化，清除病甲后局部外用抗真菌软膏，如水杨酸或咪唑类软膏、霜剂。每日2次，还可外用30%冰醋酸、碘酊、复方水杨酸酊等。这些方法均需要坚持，而且病甲要不断清除，直至，有效正常甲长出，一般要坚持半年以上。