生殖器疱疹多是由于分娩过程中经过软产道感染单纯疱疹病毒引起的，约10%是在生后感染，只有4%系宫内感染。感染原因包括病毒宫内播散，胎儿分娩时接触病毒和一些医源性因素，如医护人员带病毒的手，未严格消毒的器械等。孕妇原发性口腔单纯疱疹病毒感染也可使受累。单纯疱疹病毒感染约70%由单纯疱疹病毒-2引起，可在生后24～48小时就有异常表现，也可在1个月内出现症状。部分感染单纯疱疹病毒无任何临床症状，有症状者可表现为发热、低体温、纳差、皮损、结膜炎、角膜炎，并可伴有黄疸、发绀；累及到中枢神经系统时，可有呕吐抽搐。病情凶险，不经治疗，病死率达65%，存活儿几乎都遗留神经系统损害，如脑积水、失明、听力损害等，只有不到10%的能正常发育。