妊娠期比较早感染生殖器疱疹与自然流产和早产有关。妊娠期初发生殖器疱疹是引起先天性单纯疱疹病毒感染的主要因素。

妊娠早期（前3个月)，对胎儿影响相对较大，常有先天畸形，如：小头畸形，小眼，视网膜发育异常等。

妊娠期初发生殖器疱疹是引起先天性单纯疱疹病毒感染的主要因素。

疱疹感染是一个严重的全身性疾病，常有中枢神经系统损害，而且常是致命的。20%-50%的孕妇初发HSV感染会引起先天性单姊崎瘁病毒感染，

妊娠晚期(6个月后）如感染生殖器疱疹一般病毒滴度较高，且母亲来不及产生保护性抗体传递给胎儿，易被HSV感染。

一项46例妊娠后期使用阿昔洛韦的治疗研究表明，阿昔洛韦400mg，每天3次连续治疗，可显着减少患者的复发率和剖宫产的使用率。

妊娠期复发性生殖器疱疹：复发性生殖器疱疹患者因其免疫系统巳经产生抗HSV抗体，并可经脐血将虻休传给胎儿，故其对胎儿或引起感染的危险要小的多，约3%-5%。